Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms