Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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