Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
LtbP41155 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LtbP41155 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LtbP41155 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
LtbP41155 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LtbP41155 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
LtbP41155 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LtbP41155 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LtbP41155 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LtbP41155 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LtbP41155 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
LtbP41155 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LtbP41155 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LtbP41155 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LtbP41155 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
LtbP41155 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LtbP41155 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LtbP41155 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LtbP41155 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LtbP41155 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LtbP41155 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LtbP41155 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LtbP41155 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LtbP41155 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LtbP41155 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LtbP41155 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LtbP41155 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LtbP41155 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LtbP41155 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LtbP41155 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LtbP41155 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LtbP41155 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LtbP41155 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LtbP41155 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LtbP41155 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
LtbP41155 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LtbP41155 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LtbP41155 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LtbP41155 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LtbP41155 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LtbP41155 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LtbP41155 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LtbP41155 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LtbP41155 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LtbP41155 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LtbP41155 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LtbP41155 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LtbP41155 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LtbP41155 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LtbP41155 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LtbP41155 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LtbP41155 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LtbP41155 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LtbP41155 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LtbP41155 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LtbP41155 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LtbP41155 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LtbP41155 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LtbP41155 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LtbP41155 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LtbP41155 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LtbP41155 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LtbP41155 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LtbP41155 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LtbP41155 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LtbP41155 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LtbP41155 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LtbP41155 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LtbP41155 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LtbP41155 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
LtbP41155 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LtbP41155 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LtbP41155 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LtbP41155 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LtbP41155 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LtbP41155 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LtbP41155 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LtbP41155 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LtbP41155 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LtbP41155 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
LtbP41155 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
LtbP41155 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LtbP41155 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LtbP41155 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LtbP41155 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LtbP41155 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LtbP41155 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LtbP41155 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LtbP41155 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LtbP41155 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LtbP41155 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LtbP41155 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LtbP41155 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LtbP41155 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LtbP41155 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LtbP41155 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LtbP41155 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LtbP41155 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LtbP41155 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LtbP41155 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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