Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
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