Protein–RNA interactions for Protein: P40223

Csf3r, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3rP40223 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csf3rP40223 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csf3rP40223 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csf3rP40223 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csf3rP40223 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csf3rP40223 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csf3rP40223 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csf3rP40223 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csf3rP40223 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csf3rP40223 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csf3rP40223 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csf3rP40223 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csf3rP40223 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csf3rP40223 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csf3rP40223 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csf3rP40223 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csf3rP40223 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csf3rP40223 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csf3rP40223 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Csf3rP40223 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csf3rP40223 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csf3rP40223 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csf3rP40223 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Csf3rP40223 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csf3rP40223 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csf3rP40223 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csf3rP40223 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csf3rP40223 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Csf3rP40223 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Csf3rP40223 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Csf3rP40223 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csf3rP40223 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csf3rP40223 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Csf3rP40223 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csf3rP40223 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Csf3rP40223 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csf3rP40223 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csf3rP40223 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csf3rP40223 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csf3rP40223 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Csf3rP40223 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csf3rP40223 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csf3rP40223 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Csf3rP40223 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Csf3rP40223 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Csf3rP40223 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Csf3rP40223 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csf3rP40223 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csf3rP40223 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csf3rP40223 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Csf3rP40223 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csf3rP40223 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Csf3rP40223 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Csf3rP40223 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Csf3rP40223 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csf3rP40223 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csf3rP40223 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csf3rP40223 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csf3rP40223 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csf3rP40223 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csf3rP40223 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Csf3rP40223 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Csf3rP40223 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csf3rP40223 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Csf3rP40223 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csf3rP40223 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csf3rP40223 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csf3rP40223 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csf3rP40223 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csf3rP40223 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csf3rP40223 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Csf3rP40223 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csf3rP40223 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csf3rP40223 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csf3rP40223 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csf3rP40223 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csf3rP40223 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csf3rP40223 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Csf3rP40223 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csf3rP40223 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csf3rP40223 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csf3rP40223 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Csf3rP40223 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csf3rP40223 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Csf3rP40223 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csf3rP40223 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Csf3rP40223 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Csf3rP40223 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Csf3rP40223 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Csf3rP40223 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Csf3rP40223 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Csf3rP40223 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csf3rP40223 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csf3rP40223 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csf3rP40223 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csf3rP40223 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csf3rP40223 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csf3rP40223 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csf3rP40223 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Csf3rP40223 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms