Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chd1P40201 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chd1P40201 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chd1P40201 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chd1P40201 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chd1P40201 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chd1P40201 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Chd1P40201 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Chd1P40201 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chd1P40201 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chd1P40201 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Chd1P40201 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chd1P40201 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chd1P40201 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chd1P40201 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd1P40201 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd1P40201 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chd1P40201 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chd1P40201 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chd1P40201 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chd1P40201 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms