Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf2P39429 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf2P39429 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf2P39429 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf2P39429 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf2P39429 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Traf2P39429 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Traf2P39429 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Traf2P39429 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Traf2P39429 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Traf2P39429 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Traf2P39429 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Traf2P39429 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Traf2P39429 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Traf2P39429 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Traf2P39429 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Traf2P39429 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Traf2P39429 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Traf2P39429 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Traf2P39429 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf2P39429 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf2P39429 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf2P39429 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf2P39429 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf2P39429 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf2P39429 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf2P39429 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf2P39429 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf2P39429 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf2P39429 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf2P39429 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf2P39429 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf2P39429 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf2P39429 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf2P39429 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf2P39429 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf2P39429 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf2P39429 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf2P39429 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf2P39429 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf2P39429 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf2P39429 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf2P39429 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf2P39429 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf2P39429 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf2P39429 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf2P39429 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf2P39429 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf2P39429 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf2P39429 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf2P39429 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf2P39429 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf2P39429 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf2P39429 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf2P39429 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf2P39429 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf2P39429 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf2P39429 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms