Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lig1P37913 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lig1P37913 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Lig1P37913 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lig1P37913 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lig1P37913 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lig1P37913 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lig1P37913 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lig1P37913 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lig1P37913 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lig1P37913 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Lig1P37913 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms