Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PpargP37238 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PpargP37238 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PpargP37238 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PpargP37238 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PpargP37238 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PpargP37238 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PpargP37238 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PpargP37238 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PpargP37238 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PpargP37238 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PpargP37238 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PpargP37238 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PpargP37238 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PpargP37238 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PpargP37238 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PpargP37238 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PpargP37238 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PpargP37238 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PpargP37238 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PpargP37238 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PpargP37238 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PpargP37238 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PpargP37238 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PpargP37238 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PpargP37238 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PpargP37238 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PpargP37238 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PpargP37238 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PpargP37238 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PpargP37238 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PpargP37238 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PpargP37238 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PpargP37238 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PpargP37238 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PpargP37238 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PpargP37238 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PpargP37238 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PpargP37238 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PpargP37238 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PpargP37238 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PpargP37238 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PpargP37238 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PpargP37238 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PpargP37238 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PpargP37238 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PpargP37238 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PpargP37238 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PpargP37238 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PpargP37238 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PpargP37238 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PpargP37238 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PpargP37238 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PpargP37238 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PpargP37238 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PpargP37238 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PpargP37238 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PpargP37238 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PpargP37238 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PpargP37238 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PpargP37238 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PpargP37238 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PpargP37238 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PpargP37238 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PpargP37238 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PpargP37238 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PpargP37238 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PpargP37238 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PpargP37238 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PpargP37238 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PpargP37238 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PpargP37238 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PpargP37238 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PpargP37238 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PpargP37238 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PpargP37238 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PpargP37238 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PpargP37238 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PpargP37238 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PpargP37238 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PpargP37238 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PpargP37238 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PpargP37238 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PpargP37238 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PpargP37238 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PpargP37238 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PpargP37238 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PpargP37238 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PpargP37238 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PpargP37238 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PpargP37238 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PpargP37238 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PpargP37238 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PpargP37238 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PpargP37238 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PpargP37238 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PpargP37238 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PpargP37238 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PpargP37238 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PpargP37238 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms