Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PtprkP35822 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PtprkP35822 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PtprkP35822 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PtprkP35822 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PtprkP35822 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PtprkP35822 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PtprkP35822 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PtprkP35822 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PtprkP35822 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PtprkP35822 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PtprkP35822 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PtprkP35822 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PtprkP35822 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PtprkP35822 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PtprkP35822 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PtprkP35822 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PtprkP35822 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PtprkP35822 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PtprkP35822 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PtprkP35822 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PtprkP35822 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PtprkP35822 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PtprkP35822 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PtprkP35822 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PtprkP35822 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PtprkP35822 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PtprkP35822 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PtprkP35822 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PtprkP35822 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PtprkP35822 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PtprkP35822 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PtprkP35822 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PtprkP35822 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
PtprkP35822 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PtprkP35822 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PtprkP35822 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PtprkP35822 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PtprkP35822 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PtprkP35822 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PtprkP35822 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PtprkP35822 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PtprkP35822 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PtprkP35822 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PtprkP35822 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PtprkP35822 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PtprkP35822 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PtprkP35822 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PtprkP35822 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PtprkP35822 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PtprkP35822 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PtprkP35822 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PtprkP35822 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PtprkP35822 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PtprkP35822 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PtprkP35822 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PtprkP35822 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PtprkP35822 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PtprkP35822 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PtprkP35822 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PtprkP35822 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PtprkP35822 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PtprkP35822 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PtprkP35822 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PtprkP35822 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PtprkP35822 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PtprkP35822 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PtprkP35822 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PtprkP35822 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PtprkP35822 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PtprkP35822 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PtprkP35822 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PtprkP35822 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PtprkP35822 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PtprkP35822 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PtprkP35822 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PtprkP35822 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PtprkP35822 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PtprkP35822 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PtprkP35822 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PtprkP35822 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PtprkP35822 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PtprkP35822 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PtprkP35822 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PtprkP35822 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PtprkP35822 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PtprkP35822 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PtprkP35822 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PtprkP35822 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PtprkP35822 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PtprkP35822 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PtprkP35822 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PtprkP35822 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PtprkP35822 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PtprkP35822 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PtprkP35822 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PtprkP35822 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PtprkP35822 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PtprkP35822 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PtprkP35822 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms