Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms