Protein–RNA interactions for Protein: P35546

Ret, Proto-oncogene tyrosine-protein kinase receptor Ret, mousemouse

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Length 1,115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RetP35546 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RetP35546 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RetP35546 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RetP35546 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RetP35546 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RetP35546 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RetP35546 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RetP35546 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RetP35546 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RetP35546 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RetP35546 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RetP35546 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RetP35546 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RetP35546 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RetP35546 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RetP35546 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RetP35546 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RetP35546 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RetP35546 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RetP35546 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RetP35546 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RetP35546 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RetP35546 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RetP35546 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RetP35546 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RetP35546 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RetP35546 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RetP35546 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RetP35546 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RetP35546 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RetP35546 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RetP35546 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RetP35546 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RetP35546 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RetP35546 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RetP35546 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RetP35546 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RetP35546 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RetP35546 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RetP35546 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RetP35546 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RetP35546 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RetP35546 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RetP35546 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RetP35546 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RetP35546 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RetP35546 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RetP35546 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RetP35546 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RetP35546 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RetP35546 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RetP35546 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RetP35546 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RetP35546 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RetP35546 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RetP35546 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RetP35546 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RetP35546 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RetP35546 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RetP35546 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RetP35546 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RetP35546 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RetP35546 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RetP35546 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RetP35546 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RetP35546 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RetP35546 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RetP35546 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RetP35546 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RetP35546 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RetP35546 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RetP35546 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RetP35546 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RetP35546 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RetP35546 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RetP35546 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RetP35546 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RetP35546 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RetP35546 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RetP35546 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RetP35546 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RetP35546 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RetP35546 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RetP35546 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RetP35546 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RetP35546 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RetP35546 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RetP35546 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RetP35546 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RetP35546 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RetP35546 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RetP35546 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RetP35546 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RetP35546 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RetP35546 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RetP35546 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RetP35546 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RetP35546 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RetP35546 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RetP35546 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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