Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PpardP35396 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PpardP35396 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PpardP35396 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PpardP35396 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PpardP35396 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PpardP35396 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PpardP35396 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PpardP35396 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PpardP35396 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PpardP35396 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PpardP35396 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PpardP35396 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PpardP35396 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PpardP35396 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PpardP35396 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PpardP35396 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PpardP35396 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PpardP35396 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PpardP35396 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PpardP35396 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PpardP35396 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PpardP35396 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PpardP35396 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PpardP35396 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PpardP35396 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PpardP35396 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PpardP35396 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PpardP35396 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PpardP35396 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PpardP35396 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PpardP35396 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PpardP35396 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PpardP35396 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PpardP35396 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PpardP35396 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PpardP35396 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PpardP35396 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PpardP35396 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PpardP35396 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PpardP35396 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PpardP35396 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PpardP35396 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PpardP35396 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PpardP35396 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PpardP35396 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PpardP35396 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PpardP35396 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PpardP35396 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PpardP35396 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PpardP35396 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PpardP35396 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PpardP35396 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PpardP35396 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PpardP35396 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PpardP35396 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PpardP35396 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PpardP35396 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PpardP35396 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PpardP35396 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PpardP35396 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PpardP35396 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PpardP35396 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PpardP35396 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PpardP35396 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PpardP35396 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PpardP35396 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PpardP35396 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PpardP35396 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PpardP35396 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PpardP35396 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PpardP35396 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PpardP35396 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PpardP35396 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PpardP35396 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PpardP35396 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PpardP35396 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PpardP35396 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PpardP35396 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PpardP35396 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PpardP35396 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PpardP35396 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PpardP35396 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PpardP35396 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PpardP35396 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PpardP35396 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PpardP35396 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PpardP35396 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PpardP35396 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PpardP35396 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PpardP35396 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PpardP35396 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PpardP35396 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PpardP35396 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PpardP35396 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PpardP35396 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PpardP35396 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PpardP35396 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PpardP35396 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PpardP35396 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms