Protein–RNA interactions for Protein: P35329

Cd22, B-cell receptor CD22, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd22P35329 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd22P35329 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd22P35329 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd22P35329 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd22P35329 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd22P35329 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd22P35329 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd22P35329 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd22P35329 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd22P35329 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd22P35329 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd22P35329 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd22P35329 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd22P35329 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd22P35329 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd22P35329 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd22P35329 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd22P35329 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd22P35329 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd22P35329 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd22P35329 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd22P35329 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd22P35329 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cd22P35329 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cd22P35329 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cd22P35329 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cd22P35329 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cd22P35329 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cd22P35329 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cd22P35329 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cd22P35329 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cd22P35329 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cd22P35329 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd22P35329 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd22P35329 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd22P35329 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd22P35329 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd22P35329 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd22P35329 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd22P35329 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd22P35329 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd22P35329 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd22P35329 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd22P35329 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd22P35329 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd22P35329 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd22P35329 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd22P35329 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd22P35329 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd22P35329 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd22P35329 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd22P35329 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd22P35329 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd22P35329 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd22P35329 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd22P35329 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd22P35329 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cd22P35329 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cd22P35329 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cd22P35329 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd22P35329 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd22P35329 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd22P35329 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd22P35329 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd22P35329 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd22P35329 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd22P35329 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd22P35329 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd22P35329 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd22P35329 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd22P35329 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd22P35329 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd22P35329 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd22P35329 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd22P35329 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd22P35329 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd22P35329 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd22P35329 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd22P35329 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd22P35329 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd22P35329 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd22P35329 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd22P35329 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd22P35329 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd22P35329 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd22P35329 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd22P35329 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd22P35329 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd22P35329 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd22P35329 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd22P35329 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd22P35329 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd22P35329 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd22P35329 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd22P35329 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd22P35329 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd22P35329 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd22P35329 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd22P35329 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd22P35329 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms