Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab20P35295 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab20P35295 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab20P35295 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab20P35295 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab20P35295 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab20P35295 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab20P35295 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab20P35295 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms