Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms