Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms