Protein–RNA interactions for Protein: P29594

Casp2, Caspase-2, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp2P29594 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casp2P29594 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casp2P29594 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casp2P29594 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casp2P29594 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casp2P29594 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casp2P29594 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casp2P29594 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casp2P29594 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casp2P29594 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casp2P29594 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casp2P29594 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casp2P29594 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casp2P29594 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casp2P29594 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casp2P29594 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casp2P29594 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casp2P29594 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casp2P29594 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casp2P29594 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casp2P29594 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casp2P29594 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casp2P29594 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casp2P29594 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casp2P29594 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casp2P29594 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casp2P29594 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casp2P29594 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casp2P29594 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casp2P29594 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Casp2P29594 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casp2P29594 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casp2P29594 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casp2P29594 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casp2P29594 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casp2P29594 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casp2P29594 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casp2P29594 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casp2P29594 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casp2P29594 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casp2P29594 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casp2P29594 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casp2P29594 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casp2P29594 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casp2P29594 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casp2P29594 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casp2P29594 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casp2P29594 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casp2P29594 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casp2P29594 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casp2P29594 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Casp2P29594 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Casp2P29594 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Casp2P29594 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Casp2P29594 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Casp2P29594 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Casp2P29594 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Casp2P29594 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Casp2P29594 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Casp2P29594 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Casp2P29594 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Casp2P29594 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Casp2P29594 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Casp2P29594 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Casp2P29594 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Casp2P29594 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Casp2P29594 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Casp2P29594 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Casp2P29594 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Casp2P29594 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Casp2P29594 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Casp2P29594 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Casp2P29594 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Casp2P29594 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Casp2P29594 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Casp2P29594 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Casp2P29594 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Casp2P29594 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Casp2P29594 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Casp2P29594 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Casp2P29594 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Casp2P29594 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Casp2P29594 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Casp2P29594 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Casp2P29594 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Casp2P29594 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Casp2P29594 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Casp2P29594 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Casp2P29594 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Casp2P29594 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Casp2P29594 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Casp2P29594 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Casp2P29594 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Casp2P29594 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Casp2P29594 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Casp2P29594 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Casp2P29594 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Casp2P29594 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Casp2P29594 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Casp2P29594 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms