Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms