Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BgnP28653 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BgnP28653 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BgnP28653 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BgnP28653 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
BgnP28653 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BgnP28653 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BgnP28653 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BgnP28653 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BgnP28653 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BgnP28653 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BgnP28653 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BgnP28653 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BgnP28653 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BgnP28653 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BgnP28653 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BgnP28653 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BgnP28653 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BgnP28653 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BgnP28653 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BgnP28653 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BgnP28653 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BgnP28653 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BgnP28653 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BgnP28653 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BgnP28653 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BgnP28653 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BgnP28653 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BgnP28653 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BgnP28653 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BgnP28653 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BgnP28653 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BgnP28653 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BgnP28653 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BgnP28653 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BgnP28653 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BgnP28653 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BgnP28653 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BgnP28653 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BgnP28653 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BgnP28653 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
BgnP28653 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BgnP28653 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BgnP28653 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BgnP28653 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BgnP28653 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BgnP28653 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
BgnP28653 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BgnP28653 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BgnP28653 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BgnP28653 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BgnP28653 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BgnP28653 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BgnP28653 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BgnP28653 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BgnP28653 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BgnP28653 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
BgnP28653 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
BgnP28653 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BgnP28653 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BgnP28653 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BgnP28653 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BgnP28653 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BgnP28653 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BgnP28653 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BgnP28653 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BgnP28653 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BgnP28653 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BgnP28653 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BgnP28653 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BgnP28653 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BgnP28653 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BgnP28653 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BgnP28653 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BgnP28653 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BgnP28653 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BgnP28653 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BgnP28653 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BgnP28653 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BgnP28653 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BgnP28653 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BgnP28653 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BgnP28653 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BgnP28653 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BgnP28653 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BgnP28653 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BgnP28653 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BgnP28653 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BgnP28653 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
BgnP28653 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BgnP28653 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BgnP28653 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BgnP28653 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BgnP28653 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BgnP28653 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BgnP28653 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BgnP28653 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BgnP28653 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
BgnP28653 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BgnP28653 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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