Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa5P28312 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa5P28312 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa5P28312 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa5P28312 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa5P28312 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms