Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa2P28309 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa2P28309 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa2P28309 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa2P28309 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa2P28309 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa2P28309 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa2P28309 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms