Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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