Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms