Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd247P24161 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd247P24161 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd247P24161 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd247P24161 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd247P24161 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd247P24161 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd247P24161 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd247P24161 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms