Protein–RNA interactions for Protein: P23607

Zfa, Zinc finger autosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfaP23607 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ZfaP23607 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZfaP23607 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZfaP23607 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZfaP23607 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZfaP23607 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZfaP23607 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZfaP23607 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZfaP23607 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms