Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja1P23242 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja1P23242 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gja1P23242 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gja1P23242 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms