Protein–RNA interactions for Protein: P22907

Hmbs, Porphobilinogen deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmbsP22907 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmbsP22907 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmbsP22907 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmbsP22907 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmbsP22907 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmbsP22907 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmbsP22907 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmbsP22907 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmbsP22907 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms