Protein–RNA interactions for Protein: P21107

Tpm3, Tropomyosin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3P21107 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm3P21107 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm3P21107 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm3P21107 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm3P21107 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm3P21107 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm3P21107 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm3P21107 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm3P21107 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm3P21107 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm3P21107 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm3P21107 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm3P21107 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm3P21107 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm3P21107 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm3P21107 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm3P21107 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm3P21107 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm3P21107 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm3P21107 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm3P21107 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm3P21107 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm3P21107 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm3P21107 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tpm3P21107 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tpm3P21107 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tpm3P21107 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tpm3P21107 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tpm3P21107 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tpm3P21107 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tpm3P21107 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tpm3P21107 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tpm3P21107 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tpm3P21107 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tpm3P21107 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tpm3P21107 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tpm3P21107 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tpm3P21107 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tpm3P21107 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tpm3P21107 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tpm3P21107 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tpm3P21107 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tpm3P21107 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tpm3P21107 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tpm3P21107 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tpm3P21107 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tpm3P21107 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tpm3P21107 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tpm3P21107 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tpm3P21107 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tpm3P21107 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tpm3P21107 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tpm3P21107 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tpm3P21107 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tpm3P21107 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tpm3P21107 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tpm3P21107 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tpm3P21107 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tpm3P21107 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tpm3P21107 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tpm3P21107 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tpm3P21107 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tpm3P21107 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tpm3P21107 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tpm3P21107 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm3P21107 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm3P21107 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm3P21107 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm3P21107 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm3P21107 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm3P21107 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm3P21107 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm3P21107 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm3P21107 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm3P21107 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm3P21107 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm3P21107 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm3P21107 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm3P21107 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm3P21107 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm3P21107 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm3P21107 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm3P21107 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm3P21107 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm3P21107 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm3P21107 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm3P21107 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm3P21107 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm3P21107 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm3P21107 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tpm3P21107 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tpm3P21107 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tpm3P21107 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tpm3P21107 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tpm3P21107 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tpm3P21107 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tpm3P21107 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tpm3P21107 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tpm3P21107 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tpm3P21107 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms