Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxb9P20615 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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