Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms