Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VimP20152 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VimP20152 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VimP20152 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VimP20152 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VimP20152 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VimP20152 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VimP20152 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VimP20152 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VimP20152 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VimP20152 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VimP20152 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VimP20152 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VimP20152 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VimP20152 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VimP20152 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VimP20152 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VimP20152 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VimP20152 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VimP20152 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VimP20152 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VimP20152 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VimP20152 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VimP20152 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VimP20152 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VimP20152 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VimP20152 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VimP20152 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VimP20152 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VimP20152 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VimP20152 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VimP20152 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VimP20152 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VimP20152 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VimP20152 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VimP20152 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VimP20152 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VimP20152 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VimP20152 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VimP20152 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VimP20152 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VimP20152 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VimP20152 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VimP20152 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VimP20152 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VimP20152 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VimP20152 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VimP20152 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VimP20152 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VimP20152 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VimP20152 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VimP20152 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VimP20152 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VimP20152 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VimP20152 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VimP20152 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VimP20152 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VimP20152 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VimP20152 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VimP20152 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VimP20152 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VimP20152 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VimP20152 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VimP20152 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VimP20152 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VimP20152 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VimP20152 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VimP20152 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VimP20152 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VimP20152 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VimP20152 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VimP20152 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VimP20152 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VimP20152 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VimP20152 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VimP20152 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VimP20152 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VimP20152 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VimP20152 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VimP20152 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VimP20152 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VimP20152 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VimP20152 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VimP20152 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VimP20152 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VimP20152 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VimP20152 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VimP20152 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VimP20152 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VimP20152 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VimP20152 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VimP20152 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VimP20152 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VimP20152 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VimP20152 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
VimP20152 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
VimP20152 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
VimP20152 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
VimP20152 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VimP20152 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms