Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Csn1s1P19228 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms