Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P18533 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P18533 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P18533 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P18533 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P18533 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P18533 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P18533 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P18533 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P18533 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P18533 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
P18533 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18533 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18533 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18533 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18533 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18533 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18533 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18533 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
P18533 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18533 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18533 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
P18533 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
P18533 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18533 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18533 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18533 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18533 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
P18533 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
P18533 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18533 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18533 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18533 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18533 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18533 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18533 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18533 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18533 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18533 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18533 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18533 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P18533 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18533 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18533 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18533 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18533 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18533 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P18533 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18533 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18533 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18533 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18533 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18533 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18533 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18533 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18533 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18533 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18533 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18533 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18533 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18533 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18533 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18533 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18533 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18533 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18533 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18533 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18533 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
P18533 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18533 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18533 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
P18533 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18533 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18533 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
P18533 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
P18533 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18533 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18533 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18533 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
P18533 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18533 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18533 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18533 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18533 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18533 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18533 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18533 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18533 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
P18533 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18533 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18533 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18533 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18533 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18533 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18533 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18533 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18533 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18533 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18533 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18533 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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