Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
P18530 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P18530 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P18530 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P18530 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P18530 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P18530 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P18530 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P18530 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P18530 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P18530 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P18530 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P18530 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P18530 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P18530 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P18530 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P18530 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
P18530 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
P18530 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
P18530 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P18530 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P18530 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
P18530 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P18530 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P18530 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P18530 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P18530 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P18530 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P18530 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P18530 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P18530 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P18530 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P18530 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
P18530 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P18530 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P18530 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P18530 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P18530 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P18530 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P18530 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P18530 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P18530 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P18530 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P18530 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P18530 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P18530 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P18530 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P18530 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P18530 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
P18530 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
P18530 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P18530 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P18530 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P18530 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
P18530 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
P18530 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P18530 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P18530 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
P18530 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P18530 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P18530 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P18530 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P18530 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
P18530 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P18530 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
P18530 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P18530 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P18530 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P18530 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P18530 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P18530 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P18530 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P18530 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
P18530 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
P18530 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
P18530 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
P18530 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
P18530 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
P18530 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
P18530 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
P18530 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
P18530 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
P18530 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
P18530 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
P18530 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
P18530 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
P18530 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
P18530 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
P18530 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
P18530 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
P18530 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
P18530 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
P18530 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
P18530 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
P18530 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
P18530 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
P18530 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
P18530 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
P18530 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
P18530 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms