Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb1P17919 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb1P17919 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb1P17919 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb1P17919 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb1P17919 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb1P17919 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb1P17919 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb1P17919 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb1P17919 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb1P17919 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb1P17919 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb1P17919 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb1P17919 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb1P17919 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb1P17919 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb1P17919 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb1P17919 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb1P17919 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb1P17919 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb1P17919 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb1P17919 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb1P17919 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb1P17919 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb1P17919 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb1P17919 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb1P17919 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb1P17919 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb1P17919 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb1P17919 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb1P17919 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb1P17919 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb1P17919 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb1P17919 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb1P17919 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb1P17919 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb1P17919 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb1P17919 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb1P17919 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb1P17919 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb1P17919 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb1P17919 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb1P17919 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb1P17919 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb1P17919 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb1P17919 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb1P17919 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb1P17919 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb1P17919 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb1P17919 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb1P17919 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb1P17919 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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