Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pou4f1P17208 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pou4f1P17208 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pou4f1P17208 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pou4f1P17208 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pou4f1P17208 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pou4f1P17208 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pou4f1P17208 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pou4f1P17208 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pou4f1P17208 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pou4f1P17208 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pou4f1P17208 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pou4f1P17208 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pou4f1P17208 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pou4f1P17208 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pou4f1P17208 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pou4f1P17208 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pou4f1P17208 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pou4f1P17208 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pou4f1P17208 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pou4f1P17208 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pou4f1P17208 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pou4f1P17208 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pou4f1P17208 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pou4f1P17208 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pou4f1P17208 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pou4f1P17208 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pou4f1P17208 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pou4f1P17208 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pou4f1P17208 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pou4f1P17208 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pou4f1P17208 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pou4f1P17208 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pou4f1P17208 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pou4f1P17208 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pou4f1P17208 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pou4f1P17208 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pou4f1P17208 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pou4f1P17208 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pou4f1P17208 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pou4f1P17208 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pou4f1P17208 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pou4f1P17208 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pou4f1P17208 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pou4f1P17208 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pou4f1P17208 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pou4f1P17208 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pou4f1P17208 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pou4f1P17208 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pou4f1P17208 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pou4f1P17208 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pou4f1P17208 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pou4f1P17208 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pou4f1P17208 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pou4f1P17208 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pou4f1P17208 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pou4f1P17208 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pou4f1P17208 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pou4f1P17208 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pou4f1P17208 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pou4f1P17208 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pou4f1P17208 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou4f1P17208 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou4f1P17208 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou4f1P17208 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou4f1P17208 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou4f1P17208 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou4f1P17208 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou4f1P17208 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou4f1P17208 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou4f1P17208 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou4f1P17208 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou4f1P17208 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou4f1P17208 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou4f1P17208 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou4f1P17208 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou4f1P17208 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou4f1P17208 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms