Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp53P15975 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp53P15975 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp53P15975 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp53P15975 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp53P15975 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp53P15975 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp53P15975 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp53P15975 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp53P15975 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp53P15975 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp53P15975 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp53P15975 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp53P15975 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp53P15975 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp53P15975 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp53P15975 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp53P15975 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp53P15975 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp53P15975 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp53P15975 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp53P15975 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp53P15975 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp53P15975 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp53P15975 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp53P15975 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp53P15975 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp53P15975 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp53P15975 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp53P15975 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp53P15975 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp53P15975 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp53P15975 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms