Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fv4P11370 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fv4P11370 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fv4P11370 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fv4P11370 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fv4P11370 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fv4P11370 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fv4P11370 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fv4P11370 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fv4P11370 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fv4P11370 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fv4P11370 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fv4P11370 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fv4P11370 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fv4P11370 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms