Protein–RNA interactions for Protein: P11103

Parp1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp1P11103 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Parp1P11103 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Parp1P11103 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Parp1P11103 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Parp1P11103 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Parp1P11103 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Parp1P11103 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Parp1P11103 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Parp1P11103 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Parp1P11103 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Parp1P11103 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Parp1P11103 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Parp1P11103 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Parp1P11103 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Parp1P11103 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Parp1P11103 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Parp1P11103 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Parp1P11103 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Parp1P11103 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Parp1P11103 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Parp1P11103 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Parp1P11103 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Parp1P11103 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Parp1P11103 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Parp1P11103 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Parp1P11103 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Parp1P11103 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Parp1P11103 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Parp1P11103 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Parp1P11103 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Parp1P11103 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Parp1P11103 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Parp1P11103 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Parp1P11103 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Parp1P11103 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Parp1P11103 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Parp1P11103 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Parp1P11103 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Parp1P11103 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Parp1P11103 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Parp1P11103 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Parp1P11103 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Parp1P11103 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Parp1P11103 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Parp1P11103 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Parp1P11103 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Parp1P11103 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Parp1P11103 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Parp1P11103 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Parp1P11103 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Parp1P11103 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Parp1P11103 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Parp1P11103 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Parp1P11103 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Parp1P11103 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Parp1P11103 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Parp1P11103 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Parp1P11103 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Parp1P11103 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Parp1P11103 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Parp1P11103 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Parp1P11103 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Parp1P11103 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Parp1P11103 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Parp1P11103 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Parp1P11103 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Parp1P11103 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Parp1P11103 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Parp1P11103 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Parp1P11103 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Parp1P11103 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Parp1P11103 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Parp1P11103 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Parp1P11103 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Parp1P11103 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Parp1P11103 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Parp1P11103 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Parp1P11103 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Parp1P11103 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Parp1P11103 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Parp1P11103 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Parp1P11103 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Parp1P11103 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Parp1P11103 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Parp1P11103 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Parp1P11103 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Parp1P11103 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Parp1P11103 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Parp1P11103 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Parp1P11103 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Parp1P11103 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Parp1P11103 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Parp1P11103 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Parp1P11103 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Parp1P11103 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Parp1P11103 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Parp1P11103 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Parp1P11103 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Parp1P11103 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Parp1P11103 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms