Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CatspereP0DP43 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CatspereP0DP43 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CatspereP0DP43 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CatspereP0DP43 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CatspereP0DP43 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CatspereP0DP43 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CatspereP0DP43 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CatspereP0DP43 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CatspereP0DP43 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CatspereP0DP43 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CatspereP0DP43 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CatspereP0DP43 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CatspereP0DP43 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CatspereP0DP43 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CatspereP0DP43 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CatspereP0DP43 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CatspereP0DP43 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CatspereP0DP43 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CatspereP0DP43 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CatspereP0DP43 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CatspereP0DP43 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CatspereP0DP43 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CatspereP0DP43 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CatspereP0DP43 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CatspereP0DP43 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CatspereP0DP43 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CatspereP0DP43 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CatspereP0DP43 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CatspereP0DP43 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CatspereP0DP43 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CatspereP0DP43 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CatspereP0DP43 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CatspereP0DP43 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CatspereP0DP43 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CatspereP0DP43 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CatspereP0DP43 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CatspereP0DP43 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CatspereP0DP43 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CatspereP0DP43 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CatspereP0DP43 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CatspereP0DP43 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CatspereP0DP43 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CatspereP0DP43 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CatspereP0DP43 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CatspereP0DP43 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CatspereP0DP43 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CatspereP0DP43 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CatspereP0DP43 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CatspereP0DP43 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CatspereP0DP43 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CatspereP0DP43 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CatspereP0DP43 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CatspereP0DP43 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CatspereP0DP43 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CatspereP0DP43 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CatspereP0DP43 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CatspereP0DP43 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CatspereP0DP43 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CatspereP0DP43 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CatspereP0DP43 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CatspereP0DP43 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CatspereP0DP43 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CatspereP0DP43 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CatspereP0DP43 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CatspereP0DP43 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CatspereP0DP43 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CatspereP0DP43 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CatspereP0DP43 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CatspereP0DP43 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CatspereP0DP43 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CatspereP0DP43 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CatspereP0DP43 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CatspereP0DP43 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CatspereP0DP43 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CatspereP0DP43 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CatspereP0DP43 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CatspereP0DP43 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CatspereP0DP43 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CatspereP0DP43 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms