Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dnmt3cP0DOY1 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dnmt3cP0DOY1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dnmt3cP0DOY1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dnmt3cP0DOY1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dnmt3cP0DOY1 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms