Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms