Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Surf1P09925 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Surf1P09925 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Surf1P09925 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Surf1P09925 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Surf1P09925 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Surf1P09925 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Surf1P09925 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Surf1P09925 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Surf1P09925 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Surf1P09925 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Surf1P09925 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Surf1P09925 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Surf1P09925 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Surf1P09925 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Surf1P09925 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Surf1P09925 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Surf1P09925 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Surf1P09925 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Surf1P09925 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Surf1P09925 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Surf1P09925 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Surf1P09925 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Surf1P09925 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Surf1P09925 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Surf1P09925 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Surf1P09925 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Surf1P09925 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Surf1P09925 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Surf1P09925 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Surf1P09925 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Surf1P09925 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Surf1P09925 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Surf1P09925 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Surf1P09925 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Surf1P09925 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Surf1P09925 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Surf1P09925 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Surf1P09925 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Surf1P09925 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Surf1P09925 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Surf1P09925 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Surf1P09925 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Surf1P09925 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Surf1P09925 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Surf1P09925 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Surf1P09925 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Surf1P09925 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Surf1P09925 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Surf1P09925 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Surf1P09925 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Surf1P09925 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Surf1P09925 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Surf1P09925 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Surf1P09925 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Surf1P09925 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Surf1P09925 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Surf1P09925 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Surf1P09925 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Surf1P09925 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Surf1P09925 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Surf1P09925 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Surf1P09925 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Surf1P09925 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Surf1P09925 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Surf1P09925 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Surf1P09925 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Surf1P09925 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Surf1P09925 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Surf1P09925 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Surf1P09925 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Surf1P09925 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Surf1P09925 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Surf1P09925 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Surf1P09925 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Surf1P09925 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Surf1P09925 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Surf1P09925 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Surf1P09925 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Surf1P09925 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Surf1P09925 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Surf1P09925 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Surf1P09925 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Surf1P09925 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Surf1P09925 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Surf1P09925 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Surf1P09925 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Surf1P09925 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Surf1P09925 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Surf1P09925 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Surf1P09925 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Surf1P09925 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Surf1P09925 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Surf1P09925 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Surf1P09925 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Surf1P09925 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Surf1P09925 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Surf1P09925 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Surf1P09925 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Surf1P09925 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms