Protein–RNA interactions for Protein: P09084

Pax1, Paired box protein Pax-1, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax1P09084 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax1P09084 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax1P09084 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pax1P09084 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.3 ms