Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NefmP08553 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NefmP08553 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NefmP08553 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NefmP08553 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NefmP08553 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NefmP08553 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NefmP08553 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NefmP08553 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NefmP08553 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NefmP08553 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NefmP08553 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NefmP08553 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NefmP08553 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NefmP08553 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NefmP08553 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NefmP08553 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NefmP08553 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NefmP08553 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NefmP08553 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NefmP08553 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NefmP08553 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NefmP08553 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NefmP08553 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NefmP08553 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NefmP08553 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NefmP08553 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NefmP08553 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NefmP08553 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NefmP08553 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NefmP08553 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NefmP08553 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NefmP08553 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NefmP08553 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NefmP08553 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NefmP08553 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NefmP08553 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NefmP08553 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NefmP08553 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NefmP08553 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NefmP08553 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NefmP08553 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NefmP08553 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NefmP08553 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NefmP08553 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NefmP08553 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NefmP08553 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NefmP08553 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NefmP08553 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NefmP08553 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NefmP08553 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NefmP08553 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NefmP08553 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NefmP08553 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NefmP08553 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NefmP08553 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NefmP08553 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NefmP08553 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NefmP08553 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NefmP08553 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NefmP08553 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NefmP08553 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NefmP08553 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NefmP08553 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NefmP08553 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NefmP08553 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NefmP08553 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NefmP08553 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NefmP08553 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NefmP08553 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NefmP08553 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NefmP08553 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NefmP08553 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NefmP08553 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NefmP08553 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NefmP08553 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NefmP08553 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NefmP08553 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NefmP08553 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NefmP08553 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NefmP08553 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NefmP08553 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NefmP08553 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NefmP08553 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NefmP08553 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NefmP08553 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NefmP08553 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NefmP08553 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NefmP08553 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NefmP08553 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NefmP08553 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NefmP08553 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NefmP08553 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NefmP08553 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NefmP08553 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NefmP08553 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NefmP08553 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NefmP08553 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NefmP08553 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NefmP08553 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms