Protein–RNA interactions for Protein: P08228

Sod1, Superoxide dismutase [Cu-Zn], mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sod1P08228 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sod1P08228 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sod1P08228 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sod1P08228 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sod1P08228 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sod1P08228 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sod1P08228 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sod1P08228 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sod1P08228 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sod1P08228 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sod1P08228 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sod1P08228 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sod1P08228 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sod1P08228 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sod1P08228 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sod1P08228 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sod1P08228 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sod1P08228 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sod1P08228 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sod1P08228 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sod1P08228 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sod1P08228 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sod1P08228 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sod1P08228 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sod1P08228 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sod1P08228 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sod1P08228 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sod1P08228 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sod1P08228 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sod1P08228 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sod1P08228 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sod1P08228 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sod1P08228 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sod1P08228 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sod1P08228 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sod1P08228 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Sod1P08228 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sod1P08228 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sod1P08228 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sod1P08228 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sod1P08228 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sod1P08228 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sod1P08228 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sod1P08228 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sod1P08228 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sod1P08228 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sod1P08228 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sod1P08228 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sod1P08228 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sod1P08228 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sod1P08228 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sod1P08228 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sod1P08228 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sod1P08228 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sod1P08228 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sod1P08228 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sod1P08228 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sod1P08228 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sod1P08228 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sod1P08228 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sod1P08228 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sod1P08228 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sod1P08228 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sod1P08228 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sod1P08228 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sod1P08228 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sod1P08228 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sod1P08228 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sod1P08228 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sod1P08228 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sod1P08228 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sod1P08228 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sod1P08228 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sod1P08228 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sod1P08228 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sod1P08228 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sod1P08228 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sod1P08228 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sod1P08228 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sod1P08228 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sod1P08228 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sod1P08228 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sod1P08228 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sod1P08228 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sod1P08228 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sod1P08228 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sod1P08228 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sod1P08228 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sod1P08228 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sod1P08228 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sod1P08228 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sod1P08228 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sod1P08228 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sod1P08228 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sod1P08228 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sod1P08228 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sod1P08228 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sod1P08228 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sod1P08228 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sod1P08228 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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