Protein–RNA interactions for Protein: P06798

Hoxa4, Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4P06798 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms