Protein–RNA interactions for Protein: P04184

Tk1, Thymidine kinase, cytosolic, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tk1P04184 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tk1P04184 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tk1P04184 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tk1P04184 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tk1P04184 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tk1P04184 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tk1P04184 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tk1P04184 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tk1P04184 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tk1P04184 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tk1P04184 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tk1P04184 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tk1P04184 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tk1P04184 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tk1P04184 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tk1P04184 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tk1P04184 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tk1P04184 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tk1P04184 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tk1P04184 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tk1P04184 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tk1P04184 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tk1P04184 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms