Protein–RNA interactions for Protein: P01740

T-cell receptor gamma chain V region V108A, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01740 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01740 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01740 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01740 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01740 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P01740 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01740 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01740 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01740 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01740 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01740 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01740 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01740 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01740 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01740 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01740 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01740 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01740 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01740 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01740 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01740 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01740 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01740 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01740 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01740 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01740 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01740 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01740 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01740 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01740 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01740 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01740 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01740 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01740 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P01740 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01740 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01740 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01740 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01740 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01740 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01740 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01740 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01740 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01740 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01740 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01740 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01740 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01740 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01740 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01740 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01740 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01740 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01740 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01740 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01740 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01740 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01740 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01740 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01740 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01740 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01740 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01740 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01740 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01740 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01740 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01740 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01740 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01740 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01740 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01740 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01740 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01740 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01740 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01740 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01740 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01740 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01740 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01740 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01740 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01740 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01740 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01740 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01740 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01740 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01740 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01740 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01740 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01740 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01740 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01740 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01740 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01740 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01740 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01740 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01740 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P01740 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01740 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01740 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01740 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01740 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms